Хочу заметить, что я не такой уж большой специалист по Гинкго

У меня, растёт одно дерево в саду (сажал сеянцем в начале 2000-х), никогда его не укрывал, очень неприхотливое растение. Время от времени, я пытаюсь укоренять с него черенки (с переменным успехом), полученные саженцы, после листопада, храню в погребе.
Так как ваше растение сейчас вегетирует, в погреб его ставить не стоит, наверное лучше будет на веранде или на балконе, поближе к стеклу, где похолоднее.